淡水中的常见微生物：大型藻类、细菌、病毒、放线菌、真菌与原生动物。
池塘中细菌、真菌等微生物种类和数量一般与富营养湖相近。池塘受人为因素影响大。如养鱼池施肥和投饵可大幅度提高细菌种数、生物量和生产量。
上层水中氧含量高，主要有假单胞菌属、柄杆菌属、噬纤维菌属和浮游球衣菌等好氧菌、真菌和藻类；在中层水中，WWw.DiaoyuChan.G.cOm主要有着色菌属和绿菌属等光合细菌；在底层水中，主要有脱硫弧菌属、甲烷杆菌属和甲烷球菌属等厌氧性细菌、原生动物和一些鞘细菌。
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